贝瑞基因探索地贫筛查新策略,推进第三代测序技术临床转化

余坤
2021-07-29 13:40:49
贝瑞基因三代地贫产品全面升级,致力于临床转化。

文|余坤

近日,由贝瑞基因提供技术支持的三代地贫(即运用第三代测序技术进行地贫基因检测)多中心临床前瞻性研究成果在分子诊断期刊《The Journal of Molecular Diagnostics》上发表。该研究证明三代地贫覆盖全面、精准度高、适用性广,将有助于提升全球地贫携带者筛查的效率和精度,适合大规模临床应用。

三代地贫一次到位检测α及β地贫各类变异,准确度100%

地中海贫血简称地贫,是全世界最常见的遗传病之一,全球约3.5亿人口为地中海贫血基因携带者。该病危害严重,也是我国南方地区极为高发的遗传病,尤其在广东、广西、海南、云南、贵州等省份,有超过10% 的人为地贫基因突变携带者。目前临床上尚无经济有效的地贫治疗手段,该病患儿会给家庭和社会带来沉重的经济负担,很多家庭因病致贫、因病返贫,因此地贫防治是我国健康扶贫、创建健康中国的重要战略着力点之一。

地中海贫血携带者筛查是控制中重型地贫患儿出生的重要措施,贝瑞基因创新性的将第三代测序技术应用于地贫携带者筛查,使筛查的效率和精度全面提升。据了解,第三代测序技术的读长是NGS的100倍以上,在临床应用上具有诸多优势:测序过程中无需PCR扩增、可直接对单个分子进行测序,样本制备简单,可以检测到传统PCR方法及NGS技术遗漏的变异位点,可解决基因组高度重复序列、高GC区域、拷贝数变异、大的结构变异等问题,可实现对目标基因进行全面且精准的覆盖。

本次研究成果由中南大学医学遗传学研究中心联合南方地贫高发十省12家医院共同发表,中南大学医学遗传学研究中心、湖南家辉遗传病专科医院的邬玲仟教授为这项研究的通讯作者。邬玲仟教授指出:近50个中心、近万例地贫样本的临床研究结果显示,即使面对各种疑难样本,与各种“金标准”方法进行全面对比,三代地贫均能一次到位检测α及β地贫各类变异,且准确度为100%。

此外,无论是提高重型地贫的防控效率、避免由于误筛带来的不必要的产前诊断、临床精准遗传咨询等方面,三代地贫都有着不可替代的优势。三代地贫一次性覆盖30种以上α缺失变异、28种以上β缺失变异,超过以往所有地贫检测方法;三代地贫能精准地检测α基因多拷贝变异,助力α多拷贝合并β基因变异的“第三类”地贫的精准防控;能精准识别香港型及反香港型变异,避免误筛;三代地贫能一次到位实现顺反式变异的精准识别,无需家系验证,减少孕妇及其家属的来回奔波;对于常规基因检测方法未能明确原因的罕见型地贫,三代地贫检测能提升40-60%的诊断效能;对于传统PCR及二代地贫的假阳性和假阴性,也可行三代地贫验证。

贝瑞基因三代地贫产品全面升级,致力于临床转化

据了解,一直以来,贝瑞基因致力于基因检测技术向临床应用的全面转化。2020年,贝瑞基因创新性的应用第三代基因检测技术,提供覆盖全面、极致精准的第三代地中海贫血基因检测终极解决方案。为探索“一锤定音”地贫携带者基因筛查新策略,贝瑞基因启动“地中海贫血基因图谱(Thalassemia Gene Atlas,TiGA)计划”,通过与国内地中海贫血防控临床专家合作,充分利用贝瑞基因引进最先进的单分子实时测序技术和强大的生物信息分析能力,进一步完善中国人群地贫基因突变与临床表型数据库,促进地贫诊疗手段的发展。

近期,基于对“地中海贫血基因图谱(TiGA)计划”收集到的大量珍贵样本的进行检测分析,以及地贫防控专家的指导意见,贝瑞基因完成了三代地贫产品的全面升级,并根据临床的实际需求和具体应用场景,针对性推出多款产品。同时,贝瑞基因最新研发的三代CAH新产品也即将上市。

邬玲仟教授表示,三代测序HiFi模式的准确度高,成本可及,已满足在地贫、CAH、SMA及FXS等单病的携带者筛查及新生儿筛查上大规模临床应用的技术前提,多中心临床前瞻性研究的数据充分证实三代地贫具有广阔的临床应用前景,特别是三代地贫能实现对α三联体的精准检测,对“第三类” 地贫的精准防控意义重大。贝瑞基因也将在此基础上不断加大技术创新力度,加快推进三代测序的临床转化应用。

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